176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2220 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  100 
 
 		 535 aa  1057    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  48.18 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.88 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  45 
 
 		 635 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.86 
 
 		 567 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  50 
 
 		 488 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  50 
 
 		 511 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  47.78 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  47.78 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  47.78 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  41.67 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  41.35 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  45.95 
 
 		 578 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  47.78 
 
 		 582 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  45.95 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  45.95 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  45.56 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  45.74 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45.71 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45.71 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  43.48 
 
 		 441 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  45.92 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.76 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  43 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  43 
 
 		 567 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  41.18 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  44.14 
 
 		 578 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.35 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  44.14 
 
 		 578 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  45.92 
 
 		 601 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  45.54 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  45.92 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  45.92 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  42.74 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  48.91 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  44.9 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  44.44 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  45.56 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  45.56 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  44.44 
 
 		 514 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  44.44 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  44.44 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  44.44 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  44.44 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  44.23 
 
 		 539 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  44.44 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  44.44 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 605 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  25.42 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  44.9 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 580 aa  73.9  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.82 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  44.09 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  44.09 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  48.35 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  44.09 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  52.11 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  26.36 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  48.86 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  52.11 
 
 		 584 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  47.44 
 
 		 620 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  53.62 
 
 		 580 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  53.62 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  38.95 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  28.31 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  44.09 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  40 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  45.35 
 
 		 743 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  40 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  36.51 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  44.71 
 
 		 709 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  40 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  37.84 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  32.65 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  38.61 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  38.61 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  27.42 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  37.84 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  38.61 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  38.61 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  36.56 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  44.62 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  38.95 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  37.62 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  37.62 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  27.86 
 
 		 620 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  36.27 
 
 		 556 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  37.62 
 
 		 430 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  37.62 
 
 		 426 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  44.26 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  44.16 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 620 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 585 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  38.81 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>