More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2146 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2146  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
467 aa  887    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00275148  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
516 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  36.04 
 
 
469 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2634  ATPase domain-containing protein  38.6 
 
 
434 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  35.78 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  37.25 
 
 
483 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
478 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.04 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
344 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
513 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
462 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
398 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  34.7 
 
 
338 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
403 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
621 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  27.89 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  30.08 
 
 
501 aa  91.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.63 
 
 
373 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
546 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
682 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
682 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
665 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  31.86 
 
 
646 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
564 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
382 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  28.77 
 
 
270 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
490 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
370 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
508 aa  87.4  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.49 
 
 
830 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  30.8 
 
 
439 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
464 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
401 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
475 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
385 aa  86.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  30.04 
 
 
518 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.05 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.05 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.3 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.14 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
574 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  33.82 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1372  sensor histidine kinase  26.2 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.71 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  36.75 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.3 
 
 
640 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.02 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
348 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.03 
 
 
456 aa  84  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
725 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
545 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  27.63 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  30.77 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
655 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.56 
 
 
515 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
989 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
748 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
662 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  26.58 
 
 
246 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  26.57 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  29.81 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
700 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.26 
 
 
662 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  27.03 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.25 
 
 
636 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
586 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  31.54 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.99 
 
 
527 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  31.28 
 
 
1031 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  32.92 
 
 
710 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  29.3 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  32.92 
 
 
710 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
1168 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  32.45 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  24.27 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>