79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2127 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
316 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  52.3 
 
 
312 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  54.48 
 
 
306 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  50.71 
 
 
302 aa  274  1e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  54.48 
 
 
306 aa  273  2e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  49.48 
 
 
330 aa  270  3e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  51.23 
 
 
342 aa  269  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  51.88 
 
 
314 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  50 
 
 
298 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  49.13 
 
 
329 aa  266  3e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  50.53 
 
 
307 aa  265  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  47.35 
 
 
301 aa  265  9e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  48.43 
 
 
304 aa  262  5e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  52.28 
 
 
315 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  48.03 
 
 
334 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  48.03 
 
 
334 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  48.03 
 
 
334 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  51.24 
 
 
307 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  47.67 
 
 
301 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  49.82 
 
 
310 aa  253  2e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  48.95 
 
 
313 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  49.47 
 
 
324 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  48.6 
 
 
311 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  45.61 
 
 
312 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  45.85 
 
 
304 aa  239  3e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  45.77 
 
 
312 aa  235  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  45.55 
 
 
307 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  44.98 
 
 
311 aa  234  2e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  46.32 
 
 
319 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  47.2 
 
 
311 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  42.59 
 
 
348 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  43.09 
 
 
312 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  43.53 
 
 
312 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  40.14 
 
 
310 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  39.27 
 
 
325 aa  189  6e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  38.41 
 
 
318 aa  180  3e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  36.17 
 
 
353 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  34.49 
 
 
299 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  31.64 
 
 
298 aa  112  8e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  31.18 
 
 
284 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  30.53 
 
 
296 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  30.53 
 
 
296 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  30.53 
 
 
296 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  30.42 
 
 
286 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  27.72 
 
 
292 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  27.72 
 
 
296 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  29.47 
 
 
297 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  27.71 
 
 
311 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  29.71 
 
 
269 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  28.77 
 
 
282 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  32.07 
 
 
283 aa  99  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.62 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  30.53 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  30.72 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  29.23 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  31.5 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  28.72 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  28.83 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  30.23 
 
 
301 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  27.76 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  29.23 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.62 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  29.41 
 
 
285 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  28.52 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  27.9 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  28.06 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  26.22 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  28.92 
 
 
289 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  27.4 
 
 
301 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  26.15 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  26.95 
 
 
286 aa  84.7  2e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  28.12 
 
 
289 aa  82.8  7e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  28.63 
 
 
280 aa  81.6  1e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  28.24 
 
 
280 aa  82  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  29.55 
 
 
316 aa  79.7  6e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  21.6 
 
 
277 aa  72.8  7e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  28.46 
 
 
284 aa  70.9  3e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  23.85 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>