More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2096 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.15 
 
 
276 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.36 
 
 
276 aa  353  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.88 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 
276 aa  351  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.12 
 
 
280 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  61.31 
 
 
278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
284 aa  321  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 
286 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 
280 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.11 
 
 
284 aa  281  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 
280 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 
284 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  54.21 
 
 
284 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  56.67 
 
 
284 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
287 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
282 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  50.55 
 
 
280 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 
277 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 
277 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  48.53 
 
 
277 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 
277 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 
276 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  48.7 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
279 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  47.43 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
282 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
279 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
277 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  46.52 
 
 
276 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
279 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.71 
 
 
279 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  46.35 
 
 
280 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
276 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
276 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
277 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  44.2 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 
275 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 
281 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
275 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  44.32 
 
 
303 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
279 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
281 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
285 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
282 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
284 aa  205  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
285 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
274 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
287 aa  202  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 
275 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.69 
 
 
282 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
293 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 
282 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
283 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
283 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
279 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
279 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
283 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
279 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 
274 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 
274 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 
274 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
282 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
296 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
278 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0773345 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
291 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
277 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
281 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
258 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 
274 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
286 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
281 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
279 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
278 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
290 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
291 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
293 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
286 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.27 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
290 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
290 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
280 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>