More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2086 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
432 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  76.04 
 
 
345 aa  512  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.85 
 
 
360 aa  504  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.37 
 
 
346 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  73.85 
 
 
371 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  73.54 
 
 
370 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  74.68 
 
 
377 aa  478  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  70.54 
 
 
390 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.95 
 
 
362 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  74.68 
 
 
386 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  70.54 
 
 
390 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75 
 
 
396 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  70.54 
 
 
390 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  74.36 
 
 
385 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  70.2 
 
 
369 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.73 
 
 
378 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  72.84 
 
 
400 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  64.33 
 
 
334 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.99 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  66.87 
 
 
348 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  65.03 
 
 
369 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  64.89 
 
 
339 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  67.83 
 
 
346 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.62 
 
 
336 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  58.75 
 
 
344 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.41 
 
 
350 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  59.38 
 
 
345 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  58.31 
 
 
339 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  57.45 
 
 
337 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.78 
 
 
354 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.38 
 
 
344 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  58.36 
 
 
337 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  56.13 
 
 
345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  52 
 
 
331 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.54 
 
 
329 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  46.65 
 
 
315 aa  326  5e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.9 
 
 
342 aa  326  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.8 
 
 
331 aa  325  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  51.63 
 
 
328 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
325 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  46.01 
 
 
330 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  46.67 
 
 
333 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  51.31 
 
 
327 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48.87 
 
 
325 aa  318  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  48.1 
 
 
334 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  47.59 
 
 
340 aa  317  4e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  50 
 
 
332 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  50.79 
 
 
324 aa  315  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.61 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.21 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  52.46 
 
 
328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.84 
 
 
329 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.16 
 
 
332 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.06 
 
 
332 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.48 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.51 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.23 
 
 
317 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.6 
 
 
332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  49.42 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  52.43 
 
 
326 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.22 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  49.35 
 
 
320 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  50.16 
 
 
318 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  50.79 
 
 
335 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.31 
 
 
327 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  50 
 
 
318 aa  299  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.39 
 
 
335 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  49.37 
 
 
332 aa  296  7e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  48.02 
 
 
347 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50.49 
 
 
321 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  48.1 
 
 
319 aa  293  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  46.43 
 
 
319 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  46.33 
 
 
332 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  47.42 
 
 
333 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  48.05 
 
 
318 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  46.38 
 
 
320 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  47.54 
 
 
316 aa  292  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  48.4 
 
 
335 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  48.4 
 
 
318 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  49.35 
 
 
331 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  48.4 
 
 
318 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  50.66 
 
 
326 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.4 
 
 
318 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  48.4 
 
 
318 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  48.08 
 
 
316 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  49.02 
 
 
331 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  50.66 
 
 
326 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  49.19 
 
 
334 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
332 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  50.83 
 
 
333 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  50.83 
 
 
333 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  50.83 
 
 
333 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  49.04 
 
 
318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1989  Von Willebrand factor type A domain containing membrane protein  45.51 
 
 
359 aa  289  7e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.22 
 
 
347 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  48.38 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.11 
 
 
318 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>