More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2048 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 287 aa  564  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  64.73 
 
 		 260 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  66.54 
 
 		 263 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  64.47 
 
 		 265 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  67.29 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  65.43 
 
 		 261 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  64.31 
 
 		 258 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  62.5 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  61.4 
 
 		 261 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  61.99 
 
 		 261 aa  331  7.000000000000001e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.5 
 
 		 687 aa  330  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  62.41 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  62.36 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  60.59 
 
 		 260 aa  325  7e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  59.56 
 
 		 262 aa  324  9e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  61.34 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  58.91 
 
 		 264 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  60.22 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  58.46 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  57.8 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  58.76 
 
 		 261 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  61.09 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  62.73 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  55.72 
 
 		 271 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  57.56 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  59.93 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  57.35 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  57.72 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  57.72 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  57.72 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  57.35 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  56.04 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 263 aa  295  7e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  58.46 
 
 		 261 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  56.18 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  49.62 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.72 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.34 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  47.19 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.07 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.7 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.7 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.44 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  47.99 
 
 		 250 aa  225  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  46.49 
 
 		 250 aa  225  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  45.32 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  49.44 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  46.3 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.55 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.91 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.07 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.07 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  45.52 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  47.21 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  44.48 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  48.23 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  46.86 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  44.32 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  47.21 
 
 		 255 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  42.54 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  47.21 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.96 
 
 		 650 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  42.32 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.07 
 
 		 655 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  44.61 
 
 		 251 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  42.44 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  46.52 
 
 		 249 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.99 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  42.01 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  45.79 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  42.44 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  44.15 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.38 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  42.07 
 
 		 251 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  42.65 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.4 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>