More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2023 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 208 aa  407  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  99.52 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  70 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  63.41 
 
 		 204 aa  241  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  52.5 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  54.55 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  49.75 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  48.51 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  52.22 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  52.22 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  48.28 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  48.28 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  51.22 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  47.03 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  47.06 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  49.51 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  48.51 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  47.06 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  47.24 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  48.51 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  48.51 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  48.51 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  48.51 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  50.75 
 
 		 211 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  47.24 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  48.06 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  49.52 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  48.53 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  50.25 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  47.78 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  46.53 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  51 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  46.5 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  48 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  48.24 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  47 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  51.22 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  43.2 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  40.74 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  42.02 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  46.46 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  41.49 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  43.78 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  41.53 
 
 		 218 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  45.41 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  41.26 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  43.55 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  40.96 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  39.9 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  41.38 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  41.79 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  41.49 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  41.79 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  41.49 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  39.61 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  39.61 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  39.61 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  40.39 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  40.39 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  40.39 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  40.39 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  40.39 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  40.39 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  42.18 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  38.99 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  38.29 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  38.25 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  34.15 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.16 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 303 aa  98.6  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  33.7 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  33.15 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  33.15 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  36.27 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  33.15 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  33.15 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  33.15 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  36.46 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.75 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  32.46 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  32.24 
 
 		 220 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  32.97 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  33.16 
 
 		 197 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  35.16 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  32.38 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  36.61 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  36.17 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  34.24 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.12 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>