102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1999 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 324 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  90.29 
 
 		 309 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  90.29 
 
 		 309 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  54.65 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  33.95 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  33.95 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  25.17 
 
 		 272 aa  86.3  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  33.18 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.95 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  35.51 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  25.26 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  25.26 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  25.26 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  24.41 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  25.26 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2719  transposase, IS4  27.16 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0844  transposase, IS4  27.16 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2007  transposase, IS4  27.16 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2191  transposase, IS4  27.16 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00429854  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2197  transposase, IS4  27.16 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151302  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  34.04 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  24.32 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  24.32 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  25.17 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  25.56 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  38.31 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  31.12 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  25.28 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  24.8 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  23.98 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  23.98 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  25.69 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5439  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.948366  normal  0.697595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2904  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2980  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3108  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202313  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  30.7 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2666  transposase, IS4 family protein  24.54 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  25.23 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  26.55 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1490  hypothetical protein  25.41 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  22.76 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  36.92 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  36.92 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1269  transposase IS4 family protein  27.96 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3942  transposase, IS4 family protein  26.59 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  26.59 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  26.59 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  26.59 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  26.59 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0262  IS1381 transposase protein A  29.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.006109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0542  IS1381 transposase protein A  29.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000632314  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0965  IS1381 transposase protein A  29.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000400817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1458  IS1381 transposase protein A  29.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1549  IS1381 transposase protein A  29.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>