More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1922 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 485 aa  916    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  45.68 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  45.21 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  46.17 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  47.64 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  46.79 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  45.37 
 
 		 495 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  45.68 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  49.42 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  44.68 
 
 		 516 aa  332  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  41.85 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  40.48 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  42 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  45.94 
 
 		 491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  41.55 
 
 		 492 aa  306  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  42.11 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  39.59 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  46.98 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  45.36 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  37.78 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  45.27 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 488 aa  279  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  37.78 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  37.76 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 		 510 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 		 510 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 		 510 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  39.13 
 
 		 486 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  35.96 
 
 		 513 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  34.95 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  36.32 
 
 		 481 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 		 485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  34.16 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 486 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.16 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 490 aa  93.2  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 454 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 475 aa  90.1  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  28.78 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.93 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  29.16 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  29.28 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 511 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  27.08 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  31.15 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27.78 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  27.78 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.07 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  23.41 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.46 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  26.72 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0553  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.824768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.29 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  26.99 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  23.25 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  22.22 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  21.96 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  27.46 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  21.96 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  25.29 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>