More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1919 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  62.64 
 
 
554 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
547 aa  1079    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  65.09 
 
 
594 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  52.4 
 
 
504 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  54.47 
 
 
484 aa  475  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  49.51 
 
 
525 aa  419  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  37.55 
 
 
541 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  37.76 
 
 
540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  38.14 
 
 
535 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
546 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
545 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
584 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
569 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  36.79 
 
 
569 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  38.45 
 
 
554 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
545 aa  289  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
540 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
558 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
553 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
570 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
553 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
563 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
553 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
553 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  37.71 
 
 
553 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  37.71 
 
 
553 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
558 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
535 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  35.94 
 
 
535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
550 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
524 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
555 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  37.24 
 
 
579 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  37.02 
 
 
555 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
544 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
555 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  36.47 
 
 
541 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
570 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
535 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  35.91 
 
 
563 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
578 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  36.57 
 
 
572 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
581 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
564 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
588 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  33.76 
 
 
583 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
577 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  38.18 
 
 
585 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
550 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  35.53 
 
 
586 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  37.53 
 
 
550 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  36.02 
 
 
578 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
561 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
551 aa  231  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  31.44 
 
 
557 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.84 
 
 
537 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 
477 aa  160  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  31.61 
 
 
537 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.61 
 
 
537 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.17 
 
 
414 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
461 aa  156  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.96 
 
 
531 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 
548 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  31.16 
 
 
548 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  31.16 
 
 
548 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.67 
 
 
574 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  32.98 
 
 
408 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.78 
 
 
552 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  32.53 
 
 
407 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  34 
 
 
571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.83 
 
 
494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  34.89 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  34.27 
 
 
968 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.95 
 
 
511 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 
574 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.84 
 
 
546 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.33 
 
 
547 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.96 
 
 
537 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  31.44 
 
 
566 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.27 
 
 
388 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 
544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  36.23 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  35.47 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  31.85 
 
 
409 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.52 
 
 
533 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.76 
 
 
511 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 
505 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.65 
 
 
481 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4409  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 
405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 
546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.48 
 
 
506 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
550 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.66 
 
 
500 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>