More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1876 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  68.66 
 
 		 218 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  68.98 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  67.74 
 
 		 218 aa  291  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  66.82 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  66.67 
 
 		 217 aa  289  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  68.06 
 
 		 229 aa  287  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  64.98 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  62.84 
 
 		 223 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  64.52 
 
 		 219 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  65.28 
 
 		 221 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  64.81 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  65.74 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  65.75 
 
 		 221 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  62.04 
 
 		 222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  63.47 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  62.8 
 
 		 220 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  59.26 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  60.45 
 
 		 259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  60 
 
 		 231 aa  251  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  53.85 
 
 		 249 aa  243  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  55.5 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  56.11 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  52.44 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  56.02 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  50.67 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 		 241 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  50.46 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  54.91 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  46.64 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  48.23 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  46.12 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  36.41 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  36.41 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.44 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  36.82 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.86 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.7 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.86 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  30.59 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.72 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.68 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  33.64 
 
 		 443 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  32.44 
 
 		 445 aa  98.2  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  30.94 
 
 		 458 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.96 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  33.48 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.61 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 		 445 aa  88.6  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.62 
 
 		 630 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.78 
 
 		 459 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.35 
 
 		 445 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  30.58 
 
 		 457 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 		 626 aa  85.1  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.19 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.38 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.5 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  29.13 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  26.96 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.26 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.32 
 
 		 628 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>