More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1828 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  100 
 
 
351 aa  706    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  56.7 
 
 
351 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  54.65 
 
 
360 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  55.59 
 
 
350 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  53.56 
 
 
351 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  52.42 
 
 
351 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  52.42 
 
 
351 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  52.42 
 
 
351 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  51.28 
 
 
351 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  53.12 
 
 
353 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  52.01 
 
 
353 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  53.3 
 
 
358 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  52.15 
 
 
360 aa  362  6e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  52.41 
 
 
348 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  49.3 
 
 
348 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  52.29 
 
 
348 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  52.12 
 
 
348 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  54.15 
 
 
357 aa  358  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  50.86 
 
 
353 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  51.56 
 
 
348 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  53.3 
 
 
348 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  51.42 
 
 
353 aa  345  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  52.42 
 
 
359 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  51.14 
 
 
357 aa  342  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  50.57 
 
 
349 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  47.47 
 
 
357 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  48.83 
 
 
343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  37.5 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  37.5 
 
 
357 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  38.08 
 
 
363 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
356 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.72 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
355 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 
380 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  33.04 
 
 
369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
355 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
355 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
355 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
416 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 
360 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.63 
 
 
353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  32.58 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
356 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
376 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
363 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  35.31 
 
 
365 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.98 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  30.03 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  33.44 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  28.7 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  28.7 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
362 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.21 
 
 
418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
367 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
226 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  27.32 
 
 
234 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  31.01 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
444 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
283 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
283 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
285 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
285 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  25.58 
 
 
205 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
209 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
439 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  30.97 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
293 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.27 
 
 
313 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.88 
 
 
280 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.26 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.31 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  36.09 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  37.14 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 
223 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
440 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.43 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.1 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
267 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
209 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1310  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  35.33 
 
 
419 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>