More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1809 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1809  Glutaryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
395 aa  806    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3470  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.91 
 
 
395 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.131363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0375  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  64.49 
 
 
385 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0871  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.47 
 
 
409 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0077  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.38 
 
 
394 aa  475  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2382  Glutaryl-CoA dehydrogenase  60.26 
 
 
407 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2455  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  60.31 
 
 
398 aa  465  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.19606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.12 
 
 
393 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147907  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2061  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  62.23 
 
 
404 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3043  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.03 
 
 
402 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.942472  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1396  Acyl-CoA dehydrogenase  54.08 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.012547  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01490  Acyl-CoA dehydrogenase  51.44 
 
 
453 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.56 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5685  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.7 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3323  Glutaryl-CoA dehydrogenase  51.17 
 
 
454 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000794594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0031  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.55 
 
 
399 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30270  acyl-CoA dehydrogenase  50.13 
 
 
461 aa  362  8e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2387  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.26 
 
 
402 aa  361  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.702715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6905  Glutaryl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 
382 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1221  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.06 
 
 
466 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.395809  normal  0.664246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03070  acyl-CoA dehydrogenase  49.61 
 
 
404 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19560  acyl-CoA dehydrogenase  50.95 
 
 
400 aa  342  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.61 
 
 
442 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0434945  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1746  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.65 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.11 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0100837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.95 
 
 
396 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1877  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.39 
 
 
386 aa  325  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0874  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.21 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0223  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.17 
 
 
414 aa  319  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
402 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2522  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.86 
 
 
386 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.08 
 
 
387 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.82 
 
 
387 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.01 
 
 
392 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.64 
 
 
396 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0610  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.45 
 
 
392 aa  308  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777279  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1745  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.56 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0523297  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.79 
 
 
395 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.34 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.712311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.15 
 
 
392 aa  305  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.53 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0830  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.13 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1290  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.15 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2231  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.67 
 
 
392 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0541  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.45 
 
 
384 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1408  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
392 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.458942  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.62 
 
 
397 aa  300  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.89 
 
 
396 aa  299  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.480554  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0739  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.69 
 
 
411 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2578  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.25 
 
 
386 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
387 aa  292  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2761  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.51 
 
 
430 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.192493  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4222  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 
389 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  38.99 
 
 
395 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.05 
 
 
376 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00748225  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4147  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.05 
 
 
376 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.23 
 
 
386 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0429  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.71 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0608  acyl-CoA dehydrogenase  41.27 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.59 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  41.33 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 
385 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.73 
 
 
404 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0753  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.56 
 
 
404 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.202646  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25572  predicted protein  41.67 
 
 
470 aa  279  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1162  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.47 
 
 
404 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0873897  normal  0.0990997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.57 
 
 
396 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.43 
 
 
385 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1133  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.39 
 
 
398 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.85 
 
 
391 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.39 
 
 
408 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1436  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.49 
 
 
415 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.549354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02900  acyl-CoA dehydrogenase  40.67 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24930  Glutaryl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.35 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2451  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.36 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.38 
 
 
394 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 
397 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.145534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.42 
 
 
404 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.92 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1068  glutaryl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 
396 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1037  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.39 
 
 
396 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3170  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
422 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0539  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  39.68 
 
 
391 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3322  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 
393 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0419  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.32 
 
 
395 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.11 
 
 
408 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0815  glutaryl-CoA dehydrogenase  39.33 
 
 
394 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 
401 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4297  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.75 
 
 
404 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296437  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.89 
 
 
413 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.46 
 
 
389 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1671  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.52 
 
 
398 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.52 
 
 
394 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 
395 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224399  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1193  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.73 
 
 
394 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0805  putative glutaryl-CoA dehydrogenase  39.07 
 
 
394 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75963  normal  0.310028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.56 
 
 
389 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>