246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1788 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.95 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.09 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.62 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.62 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.62 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.31 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  34.27 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  36.27 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.07 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.97 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  37.43 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  27.66 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  28.64 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  28.64 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  29.82 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  29.36 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  29.36 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  29.36 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  28.64 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  28.64 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  26.6 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  26.6 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  26.6 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  26.6 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.87 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  27.13 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  26.6 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  27.47 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  27.13 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  28.18 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  29.91 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  33.16 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.32 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  26.6 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.35 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  32.26 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  32.26 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  26.82 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.76 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.93 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.86 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.89 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.49 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.49 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.57 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  28.14 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.02 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  28.02 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.82 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.68 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  28.96 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.47 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.47 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.47 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.89 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.19 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.47 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  28.02 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.11 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.19 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.47 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  27.47 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  27.47 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  29.77 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  30.27 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.89 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  25.82 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  25.82 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  25.82 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  35.48 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.11 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.78 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.79 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  25.73 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.31 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.28 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.33 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.35 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  25.24 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  25.24 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.57 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  26.9 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.24 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  25.24 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  25.24 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  25.56 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  25.56 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  25.24 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>