More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1786 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 386 aa  766    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  61.2 
 
 		 391 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  58.84 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  45.1 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  47.55 
 
 		 390 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  43.36 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  43.89 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  41.35 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  37.99 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  47.46 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  39.49 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  37.4 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  29.95 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  40.11 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  29.55 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  29.82 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  35.81 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  29.68 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  29.95 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  30.48 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  29.82 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  29.55 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  40.59 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  36.04 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  29.41 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  36.06 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  29.41 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  38.18 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  40.32 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  34.41 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  38.42 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  35.86 
 
 		 401 aa  219  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 		 412 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  31.93 
 
 		 393 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.5 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  35.66 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  36.79 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  35.96 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  31.65 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  38.56 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  32.66 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  32.53 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  31.54 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  37.03 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  32.43 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 386 aa  209  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  31.96 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.28 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.25 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.96 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  35.94 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  27.23 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  34.1 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  33.33 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.27 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 		 391 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  38.8 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 		 398 aa  192  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  29.09 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  30.18 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  33.08 
 
 		 392 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 		 393 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 		 392 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.79 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  28.04 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  32.86 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  32.04 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  29.97 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 		 384 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  35.96 
 
 		 376 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  35.37 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  35.31 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  35.37 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  34.03 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  32.97 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  32.97 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>