123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1726 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.06 
 
 
1089 aa  69.3  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.42 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  34.15 
 
 
1050 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.05 
 
 
629 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  53.62 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.07 
 
 
317 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.85 
 
 
143 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.51 
 
 
364 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.57 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.35 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.25 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  53.73 
 
 
423 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45 
 
 
554 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.27 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.78 
 
 
306 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.31 
 
 
531 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  45.71 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  32.54 
 
 
438 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.27 
 
 
288 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.55 
 
 
322 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.76 
 
 
200 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.7 
 
 
274 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.56 
 
 
280 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.03 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.69 
 
 
554 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  44.44 
 
 
462 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
974 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.76 
 
 
372 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.65 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
128 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  47.83 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  41.54 
 
 
246 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  44.78 
 
 
358 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 
170 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 
249 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.48 
 
 
485 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.21 
 
 
332 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.4 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.16 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.39 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.31 
 
 
635 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  46.88 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0291  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.04 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.93701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  46.27 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  43.28 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.03 
 
 
464 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  45.59 
 
 
276 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  41.18 
 
 
438 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 
665 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  48.33 
 
 
349 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  46.58 
 
 
204 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 
433 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
285 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.88 
 
 
422 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.9 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  50.85 
 
 
383 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 
379 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.5 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  49.18 
 
 
396 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.84 
 
 
792 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.45 
 
 
283 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.57 
 
 
356 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55 
 
 
447 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.27 
 
 
260 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.16 
 
 
327 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.73 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.85 
 
 
382 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.08 
 
 
575 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0109  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  40 
 
 
361 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.880335  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.85 
 
 
356 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 
313 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.66 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
400 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 
274 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlA  42.03 
 
 
364 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0248425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4456  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.24 
 
 
266 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.57 
 
 
233 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 
163 aa  45.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  37.33 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.88 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  43.75 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  44.44 
 
 
395 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2364  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.62 
 
 
92 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  66.67 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.88 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4180  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  50 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4246  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537178  normal  0.324419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4402  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  37.33 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.06 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 
77 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.14 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>