More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1592 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  66.04 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  65.82 
 
 		 184 aa  208  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  64.38 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  61.25 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  62.26 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  61.25 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  61.49 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  62.11 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  59.49 
 
 		 183 aa  194  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  62.89 
 
 		 181 aa  193  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  60.38 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  57.59 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  60.38 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  59.49 
 
 		 181 aa  190  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  59.12 
 
 		 162 aa  187  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  59.75 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  59.38 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  56.96 
 
 		 188 aa  184  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  59.12 
 
 		 182 aa  183  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  59.12 
 
 		 181 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  57.59 
 
 		 186 aa  180  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  57.76 
 
 		 163 aa  178  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  57.23 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  55.06 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  51.88 
 
 		 183 aa  163  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  55 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  51.9 
 
 		 180 aa  160  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.75 
 
 		 197 aa  157  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  45.1 
 
 		 230 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  60.69 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.83 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  51.19 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  47.77 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  50.34 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.87 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  46.95 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  45.35 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  45.61 
 
 		 190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  46.58 
 
 		 213 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.81 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  45.24 
 
 		 230 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  43.48 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  45.16 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  44.38 
 
 		 197 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  44.38 
 
 		 197 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  44.38 
 
 		 197 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  43.26 
 
 		 197 aa  120  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  43.58 
 
 		 197 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  44.13 
 
 		 197 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.5 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.5 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.97 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  42.86 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  45.96 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  46.75 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  43.95 
 
 		 227 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  39.66 
 
 		 192 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40.69 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.77 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.79 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  42.86 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  37.89 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  40.14 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  39.38 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  42.18 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.2 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.2 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  40.13 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  38.36 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  39.38 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  40.41 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.47 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.67 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  42.77 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  42.36 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  44.19 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.41 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  39.74 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  42.5 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  37.16 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  32.89 
 
 		 169 aa  104  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  40.99 
 
 		 221 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  37.5 
 
 		 213 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  35.9 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  40.11 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  40.69 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  35.58 
 
 		 175 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.24 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  42.42 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.51 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  39.46 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  39.19 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  38.78 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  39.19 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  39.19 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  37.01 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  38.51 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  36.5 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>