More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1581 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 862 aa  1044    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 872 aa  1067    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  67.13 
 
 		 881 aa  1157    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 877 aa  1102    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 876 aa  1184    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 860 aa  1066    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  100 
 
 		 861 aa  1742    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.61 
 
 		 858 aa  1103    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 906 aa  1082    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 		 903 aa  1110    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 901 aa  1059    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 885 aa  1079    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 855 aa  851    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  63.5 
 
 		 886 aa  1094    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 911 aa  977    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  71.83 
 
 		 846 aa  1202    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  55.35 
 
 		 925 aa  953    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  68.48 
 
 		 836 aa  1159    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  61.16 
 
 		 916 aa  1041    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 		 873 aa  1075    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 902 aa  1048    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 		 895 aa  1072    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 871 aa  1046    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 845 aa  1156    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  62.17 
 
 		 894 aa  1092    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 864 aa  592  1e-168  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 808 aa  568  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 802 aa  553  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 896 aa  525  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 928 aa  525  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 908 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 905 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 892 aa  490  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 855 aa  465  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 863 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 864 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 886 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 865 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 886 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 865 aa  438  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 863 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 906 aa  423  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 865 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 809 aa  419  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 858 aa  416  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 771 aa  383  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 799 aa  379  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 816 aa  373  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 799 aa  375  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 799 aa  371  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 799 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 806 aa  362  2e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 877 aa  351  3e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 808 aa  345  2.9999999999999997e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 882 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 882 aa  304  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 872 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 880 aa  301  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 893 aa  299  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 		 879 aa  296  9e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 881 aa  296  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 882 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 877 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 880 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 883 aa  295  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 881 aa  294  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 881 aa  294  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 872 aa  294  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 897 aa  293  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 881 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 891 aa  293  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 880 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 881 aa  292  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 881 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 882 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 881 aa  291  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 883 aa  290  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 904 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2630  valyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 900 aa  289  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5430  valyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 905 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0396856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 903 aa  289  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 1002 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 903 aa  288  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 885 aa  287  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 883 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 929 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 909 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 879 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 906 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 		 884 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 904 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 		 883 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>