231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1523 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
134 aa  277  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  49.6 
 
 
167 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
129 aa  107  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
283 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  44.35 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 
132 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  37.33 
 
 
183 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  38.52 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
147 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  38.1 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.19 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  36.89 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  33.09 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  33.09 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  34.35 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  31.06 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  32.19 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  31.67 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  32.82 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  29.11 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  33.85 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  35.78 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  29.73 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  28.28 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.04 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  32.81 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.22 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  32.11 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  38.81 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>