251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1483 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  66.82 
 
 		 867 aa  1139    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  66.2 
 
 		 871 aa  1119    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  65.8 
 
 		 863 aa  1102    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  67.87 
 
 		 899 aa  1121    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  47.64 
 
 		 820 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  67.18 
 
 		 881 aa  1096    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  66.51 
 
 		 836 aa  1089    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  64.4 
 
 		 859 aa  1073    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.64 
 
 		 792 aa  711    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  51.93 
 
 		 779 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  47.2 
 
 		 826 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  65.65 
 
 		 838 aa  1025    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  100 
 
 		 872 aa  1746    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  66.83 
 
 		 884 aa  1060    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  70.25 
 
 		 859 aa  1176    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  66.51 
 
 		 842 aa  1115    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  66.51 
 
 		 852 aa  1133    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  67.69 
 
 		 841 aa  1121    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  64.4 
 
 		 859 aa  1073    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  64.9 
 
 		 859 aa  1065    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  55.23 
 
 		 811 aa  790    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  64.4 
 
 		 859 aa  1075    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  64.01 
 
 		 856 aa  1054    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  68.02 
 
 		 875 aa  1137    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  64.97 
 
 		 859 aa  1060    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  66.07 
 
 		 860 aa  1057    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  69.59 
 
 		 857 aa  1176    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  49.57 
 
 		 800 aa  743    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.27 
 
 		 841 aa  586  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  74.55 
 
 		 944 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  45.56 
 
 		 757 aa  559  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  60.05 
 
 		 416 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  64.61 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.66 
 
 		 741 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.29 
 
 		 737 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.09 
 
 		 737 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  49.07 
 
 		 429 aa  363  8e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  50.4 
 
 		 418 aa  358  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  50.13 
 
 		 435 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  43.98 
 
 		 392 aa  337  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  50.41 
 
 		 380 aa  334  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  43.94 
 
 		 362 aa  313  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  45.57 
 
 		 386 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 		 419 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  48.33 
 
 		 376 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  43.35 
 
 		 359 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  43.64 
 
 		 359 aa  303  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.86 
 
 		 453 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  43.06 
 
 		 370 aa  299  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.82 
 
 		 382 aa  298  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  47.06 
 
 		 381 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  40.75 
 
 		 359 aa  293  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  47.52 
 
 		 365 aa  291  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.16 
 
 		 352 aa  289  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  47.22 
 
 		 358 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  46.65 
 
 		 391 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  45.65 
 
 		 372 aa  285  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  44.1 
 
 		 362 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  44.38 
 
 		 376 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  44.14 
 
 		 384 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  40.84 
 
 		 352 aa  277  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  44.14 
 
 		 384 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  45.09 
 
 		 356 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  41.91 
 
 		 358 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  40.48 
 
 		 352 aa  273  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 367 aa  272  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  41.57 
 
 		 380 aa  271  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  44.01 
 
 		 398 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.9 
 
 		 366 aa  270  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  42.49 
 
 		 358 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.18 
 
 		 419 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  42.7 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 390 aa  267  7e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  48.07 
 
 		 386 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.49 
 
 		 329 aa  263  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.64 
 
 		 384 aa  262  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  42.49 
 
 		 358 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  39.45 
 
 		 351 aa  260  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  44.7 
 
 		 368 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 		 362 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  43.24 
 
 		 331 aa  248  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.94 
 
 		 389 aa  244  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  46.28 
 
 		 387 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.53 
 
 		 356 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 355 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  38.62 
 
 		 361 aa  241  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 327 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 362 aa  238  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 355 aa  234  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  39.13 
 
 		 361 aa  233  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  43.12 
 
 		 360 aa  233  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 360 aa  233  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 367 aa  233  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  40.61 
 
 		 358 aa  233  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.11 
 
 		 393 aa  232  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  42.99 
 
 		 626 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  43.6 
 
 		 372 aa  229  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 		 625 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3629  conserved hypothetical protein; putative SAM domain  46.13 
 
 		 339 aa  229  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 		 364 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>