187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1436 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 614 aa  1211    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  60.17 
 
 		 607 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000542956  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  44.6 
 
 		 563 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  42 
 
 		 564 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  43.5 
 
 		 583 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  43.34 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  41.49 
 
 		 575 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  39.28 
 
 		 564 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  43.58 
 
 		 546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  38.85 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  39.75 
 
 		 564 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  32.52 
 
 		 562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 347 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.84 
 
 		 352 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.62 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.42 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.87 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.84 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.3 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.3 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.3 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  23.92 
 
 		 337 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.86 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.91 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.23 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.8 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  28.64 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.19 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.87 
 
 		 384 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.78 
 
 		 355 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  26.55 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  28.06 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  23.24 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  22.22 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  22.22 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  22.22 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.95 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  21.64 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.01 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.38 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.1 
 
 		 395 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25 
 
 		 357 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  22.22 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.78 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  22.54 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.97 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.16 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 330 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.62 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 		 356 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  21.78 
 
 		 337 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  20.85 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  22.22 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  26.96 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.01 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.29 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  24.86 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.29 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.17 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  24.6 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  27.78 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  18.59 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.53 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  25.88 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  22.36 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  25.09 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.51 
 
 		 350 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.16 
 
 		 332 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  23.42 
 
 		 332 aa  55.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  23.81 
 
 		 347 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 		 399 aa  53.9  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 335 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  24.4 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  26.4 
 
 		 676 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  29.36 
 
 		 749 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.53 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  26.4 
 
 		 676 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  30.58 
 
 		 658 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1057  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 622 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  30.53 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0789  potassium efflux system protein  32.8 
 
 		 670 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00221734  normal  0.126459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1862  potassium efflux system protein  30.15 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.508277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>