68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1426 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  64.71 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  64.71 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  64.71 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  61.08 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  63.51 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  57.4 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  55.23 
 
 		 196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  52.78 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  38.04 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  38.04 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  42.86 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  40.7 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  40.23 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  36.21 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  35.63 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  35.59 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  35.59 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  38.51 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  36.16 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  37.29 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  35.8 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  34.46 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  35.63 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  43.15 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  46.45 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  44.19 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  40.91 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  35.43 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  36.67 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  33.14 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  31.76 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  38.41 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  38.12 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  38.12 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  41.94 
 
 		 307 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  33.79 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  33.91 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  34.67 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  42.58 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  35.88 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  41.29 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  34.94 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  33.77 
 
 		 154 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  21.95 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  45.57 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  24.86 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  22.42 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  21.21 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  29.55 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  35.54 
 
 		 319 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  33.83 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  30.15 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  29.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  33.55 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1742  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  28.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  26.74 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  31.21 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  33.91 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>