117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1421 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  61.36 
 
 		 188 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 187 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  35.47 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  30.98 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.44 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  42.75 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 180 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  31.78 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  35.77 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  33.63 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  33.63 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  33.63 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  24.86 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  26.45 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
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NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 186 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
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NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 191 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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