More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1370 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  45.79 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 383 aa  121  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.94 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 237 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.8 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.33 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  40.8 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  46.74 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.8 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.93 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  24.04 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.28 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  35.2 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.67 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>