162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1347 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  55.5 
 
 		 411 aa  301  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  47.19 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  40.21 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  43.44 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 417 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 424 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  35 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  32.72 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  33.21 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  33.21 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  33 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.56 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  28 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  25.17 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  25.24 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  25.24 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  25.24 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  24.67 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  25 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  23.57 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  24.01 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  32.53 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  33.57 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  35 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  35 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  35 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  30.59 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  32.12 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  30 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  29.09 
 
 		 917 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  26.48 
 
 		 893 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  32.73 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.99 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1588  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.245234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  28.37 
 
 		 905 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.07 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  31.18 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.25 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>