88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1346 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
167 aa  327  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  63.47 
 
 
168 aa  220  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  68.55 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  64.02 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  67.08 
 
 
179 aa  214  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  65.45 
 
 
168 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  63.35 
 
 
182 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  65.41 
 
 
172 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  65.41 
 
 
172 aa  208  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  64.78 
 
 
172 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  56.02 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  59.41 
 
 
178 aa  178  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  53.99 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  45.4 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  41.38 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.23 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.17 
 
 
160 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.69 
 
 
165 aa  84  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.41 
 
 
166 aa  84  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  31.01 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.86 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.13 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.99 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  29.94 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  29.94 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.22 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.21 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  34.72 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.56 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.89 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.78 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.17 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.72 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  27.97 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.13 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  32.33 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.56 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  27.74 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  39.17 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  38.03 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  26.83 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.07 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.07 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.84 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 
186 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.74 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.81 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  32.09 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  31.08 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.67 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.67 
 
 
173 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  35.83 
 
 
173 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  22.81 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
182 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  25.53 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.44 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  29.2 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  38.24 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  35.26 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  26.57 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  33.81 
 
 
159 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.77 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  26.25 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.93 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  35.25 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.34 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  31.62 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.6 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  28.15 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.82 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  26.27 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  24.43 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  26.27 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  36.71 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  26.27 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  29.63 
 
 
148 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4037  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
235 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3673  metallophosphoesterase  31.31 
 
 
234 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  31.78 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  32.77 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.41 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1174  metallophosphoesterase  45.1 
 
 
229 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0750228  normal  0.054455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>