216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1261 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  59.41 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  56.17 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  51.27 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  49.19 
 
 		 244 aa  241  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  54.63 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  51.88 
 
 		 235 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  46.44 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  45.19 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  53.05 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  52.07 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  45.15 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  47.72 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  43.95 
 
 		 243 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  45.38 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  43.95 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  44.39 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  44.77 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  43.24 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  43.5 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  43.69 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  43.24 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  42.24 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  50 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  46.19 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  45.66 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  42.8 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  41.59 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  39.26 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0591  DSBA oxidoreductase  44.12 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  46.91 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  47.62 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  44.86 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  41.78 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  46.01 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4148  DSBA oxidoreductase  42.44 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  47.51 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  41.77 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  41.53 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  41.53 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  41.77 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  42.19 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  42.44 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  39.5 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  46.12 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  44.34 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.02 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  43.06 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  41.04 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4261  isomerase, putative  36.91 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  33.2 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  35.16 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  38.74 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  38.5 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 217 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  37.79 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  35.68 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  34.4 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  34.7 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  39.55 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  40.09 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  38.39 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  35.85 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  33.18 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.19 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  35.85 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  36.28 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.03 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  34.6 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  36.87 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  37.33 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>