254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1260 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  76.89 
 
 		 859 aa  1200    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 900 aa  1743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  74.17 
 
 		 992 aa  1094    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  71.37 
 
 		 1000 aa  943    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  72.86 
 
 		 897 aa  1161    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  42.65 
 
 		 934 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  40.85 
 
 		 829 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  45.88 
 
 		 675 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  34.2 
 
 		 1309 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.38 
 
 		 1324 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 911 aa  361  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  35.71 
 
 		 845 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  34.83 
 
 		 1500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1383 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  35.76 
 
 		 899 aa  355  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  33.41 
 
 		 838 aa  354  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.38 
 
 		 785 aa  353  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.49 
 
 		 1068 aa  340  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.14 
 
 		 1056 aa  336  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.94 
 
 		 963 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  33.25 
 
 		 843 aa  327  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  32.92 
 
 		 849 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.08 
 
 		 1314 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1523 aa  297  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  32.67 
 
 		 1509 aa  281  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  31.53 
 
 		 1311 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  40.72 
 
 		 385 aa  220  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  34.01 
 
 		 686 aa  217  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.9 
 
 		 713 aa  214  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1010 aa  207  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.22 
 
 		 1261 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  54.72 
 
 		 234 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.26 
 
 		 1326 aa  190  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.95 
 
 		 801 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1039 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 1050 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 1128 aa  180  8e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1088 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  43.23 
 
 		 373 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 1288 aa  175  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.64 
 
 		 793 aa  172  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1283 aa  171  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 1146 aa  160  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.55 
 
 		 1424 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 1125 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 		 1185 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.88 
 
 		 1131 aa  155  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  34.63 
 
 		 457 aa  155  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 1262 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 857 aa  151  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.66 
 
 		 828 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 850 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 		 1136 aa  124  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1209  hypothetical protein  69.23 
 
 		 110 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1105 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  48.12 
 
 		 358 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  27.9 
 
 		 1468 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 953 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 924 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.32 
 
 		 1488 aa  110  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 966 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 837 aa  107  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1404 aa  105  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  28.28 
 
 		 958 aa  104  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 		 577 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  38.27 
 
 		 266 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1212 aa  96.3  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 640 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  41.13 
 
 		 405 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  30.4 
 
 		 715 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  36.2 
 
 		 237 aa  94.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 751 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 841 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  37.5 
 
 		 157 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  36.75 
 
 		 238 aa  92  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  38.13 
 
 		 1355 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 1186 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  33 
 
 		 374 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  39.47 
 
 		 540 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 454 aa  88.6  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  36.5 
 
 		 235 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 814 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  38.51 
 
 		 564 aa  85.5  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  33.88 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  25.26 
 
 		 1228 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 843 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 652 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  39.58 
 
 		 161 aa  82.4  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.82 
 
 		 1003 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  32.52 
 
 		 705 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1017 aa  78.2  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 671 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.75 
 
 		 825 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  31.73 
 
 		 392 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  24.79 
 
 		 965 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  29.31 
 
 		 847 aa  74.3  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.68 
 
 		 1901 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>