More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1240 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 295 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  52.01 
 
 		 278 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  32.31 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.65 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  30.04 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6047  alpha/beta family hydrolase  32.49 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.2 
 
 		 639 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0446  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.352973  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.62 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  29.47 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  27.2 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  30.88 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  23.62 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>