65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1208 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  100 
 
 		 396 aa  804    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  48.29 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  42.46 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  41.92 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  39.55 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  41.11 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  39.83 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  39.28 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  39.55 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  39.55 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  39.55 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  39.55 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  38.07 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  39.28 
 
 		 345 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  44.4 
 
 		 337 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  44.4 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  40.95 
 
 		 523 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  42.35 
 
 		 530 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  36.26 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  36.89 
 
 		 514 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  40.79 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  40.43 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  36.95 
 
 		 595 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  35.74 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  37.1 
 
 		 777 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  31.93 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  30.92 
 
 		 721 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  36.46 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  36.46 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  35.14 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  38.77 
 
 		 357 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  35.59 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  35.15 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  32.23 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  32.24 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  35.02 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  33.23 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  35.5 
 
 		 746 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  33.23 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  32.15 
 
 		 566 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  33.61 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  30.57 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  31.21 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  29.68 
 
 		 831 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  29.83 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  31.06 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  31.37 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  33.74 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  28.37 
 
 		 520 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  27.11 
 
 		 514 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  28.04 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  29.38 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  27.68 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  30.05 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  29.38 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  23.5 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  26.67 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  26.49 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  25.54 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  25.54 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  25.54 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  28.87 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  26.81 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>