210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1190 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  100 
 
 		 629 aa  1239    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  25.59 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  26.12 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  25.59 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  25.59 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  25.59 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  25.59 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  25.59 
 
 		 408 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.46 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  27.61 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  27.61 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  27.61 
 
 		 417 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.24 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  27.61 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  28.57 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.86 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  27.24 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  37.7 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.36652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  29.03 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  27.95 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  26.96 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  25 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  33.04 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27.17 
 
 		 677 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.09 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  32.11 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  34.59 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  32.3 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  32.3 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  24.93 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  32.3 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.38 
 
 		 531 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.17 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  27.96 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  34.74 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  33.66 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  31.09 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.86 
 
 		 450 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  32.64 
 
 		 625 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.86 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.42 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  27.3 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  27.2 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  32.5 
 
 		 569 aa  62  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  25.7 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  40.4 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  26.79 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  32.16 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  29.35 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.97 
 
 		 557 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  28.17 
 
 		 312 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  31.37 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  34.67 
 
 		 947 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  39.17 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  31.28 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  30.34 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  31 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  27.76 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  34.23 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  34.4 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  34.4 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  34.65 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.91 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  34.4 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.91 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.14 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  35.48 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  46.74 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  32.78 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  32.72 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  46.74 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  46.74 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.12 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  33.94 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  43.75 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  26.57 
 
 		 306 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  45.65 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  29.32 
 
 		 591 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  28.1 
 
 		 597 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  45.65 
 
 		 481 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  29.22 
 
 		 434 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  45.65 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  37.01 
 
 		 471 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  28.79 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  34.75 
 
 		 548 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.57 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  38.79 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  32.47 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  45.65 
 
 		 468 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  29.38 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  29.38 
 
 		 466 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  29.38 
 
 		 466 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  33.78 
 
 		 551 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  44.57 
 
 		 468 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  26.84 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  44.57 
 
 		 469 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.38 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  29.38 
 
 		 466 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  29.38 
 
 		 466 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  29.38 
 
 		 466 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>