More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1125 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 523 aa  996    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.77 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.27 
 
 		 497 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.27 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.27 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.02 
 
 		 512 aa  292  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.31 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.74 
 
 		 544 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  42.63 
 
 		 517 aa  270  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.21 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  42.48 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.85 
 
 		 349 aa  256  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  46.31 
 
 		 527 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.33 
 
 		 420 aa  240  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  48.18 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.4 
 
 		 640 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.62 
 
 		 558 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.83 
 
 		 674 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.16 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  49 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  45.83 
 
 		 423 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  48.12 
 
 		 537 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  50.82 
 
 		 575 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.12 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  47.19 
 
 		 515 aa  230  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  45.4 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.9 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.9 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  44.32 
 
 		 597 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  48.56 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.14 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  41.6 
 
 		 583 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.28 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.28 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.28 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.64 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  44.98 
 
 		 584 aa  223  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.76 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.3 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.3 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.05 
 
 		 916 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.73 
 
 		 512 aa  217  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.08 
 
 		 515 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 		 426 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.51 
 
 		 579 aa  213  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.36 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.16 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  41.12 
 
 		 594 aa  211  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.88 
 
 		 497 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.8 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  47.84 
 
 		 511 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  45.36 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.16 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  45.36 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  45.36 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  44.64 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  44.64 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  44.64 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  39.76 
 
 		 455 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  45 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  46.08 
 
 		 469 aa  206  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  44.29 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  38.83 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  44.64 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  42.35 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.99 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  38.55 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  44.64 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  43.37 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43 
 
 		 417 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  38.55 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  43.37 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  43.37 
 
 		 455 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  43.37 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  42.55 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.13 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  46.26 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  44.29 
 
 		 450 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  43.01 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  44.33 
 
 		 457 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  44.33 
 
 		 457 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  44.33 
 
 		 463 aa  203  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  42.5 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  43.57 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.04 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  43.57 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  43.57 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  43.93 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  43.57 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  43.57 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  43.93 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  37.25 
 
 		 489 aa  200  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  43.11 
 
 		 496 aa  200  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.37 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>