More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1089 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  63.47 
 
 		 593 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  56.23 
 
 		 594 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 607 aa  1196    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  62.4 
 
 		 594 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  59.15 
 
 		 597 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  55.56 
 
 		 599 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  55.25 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  55.16 
 
 		 593 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  56.19 
 
 		 600 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  57.49 
 
 		 615 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  54.43 
 
 		 624 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  53.77 
 
 		 594 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  53.29 
 
 		 613 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  53.62 
 
 		 609 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  56.32 
 
 		 616 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  53.31 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  58.18 
 
 		 612 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  55.01 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  57 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  31.45 
 
 		 564 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.33 
 
 		 545 aa  233  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.76 
 
 		 570 aa  231  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  31.76 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.76 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.76 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.24 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.48 
 
 		 568 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 		 630 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31.27 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.27 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  31.27 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  31.11 
 
 		 570 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  29.79 
 
 		 643 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.08 
 
 		 590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.28 
 
 		 565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  31.27 
 
 		 563 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  31.46 
 
 		 593 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  31.37 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.17 
 
 		 579 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.99 
 
 		 536 aa  203  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  32.71 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 		 541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  30.68 
 
 		 537 aa  200  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.79 
 
 		 565 aa  200  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  31.52 
 
 		 529 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  30.44 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  33.5 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  30.46 
 
 		 534 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  30.82 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.78 
 
 		 586 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  28.31 
 
 		 534 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.43 
 
 		 533 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.56 
 
 		 527 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  32.25 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  31.66 
 
 		 531 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  27.97 
 
 		 561 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  28.28 
 
 		 592 aa  179  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  33.1 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  29.9 
 
 		 529 aa  177  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.78 
 
 		 597 aa  176  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.94 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 		 568 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  29.81 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  29.74 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  35.03 
 
 		 595 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.83 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  28.09 
 
 		 530 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.98 
 
 		 538 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  30.66 
 
 		 534 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.15 
 
 		 538 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  30.18 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  27.11 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  29.88 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  33.11 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  26.64 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  28.38 
 
 		 587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.41 
 
 		 587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  32.54 
 
 		 525 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  30.57 
 
 		 538 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  28.18 
 
 		 587 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  29.37 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  31.93 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.24 
 
 		 587 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 		 596 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  29.2 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  29.12 
 
 		 529 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  25.97 
 
 		 589 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  29.79 
 
 		 537 aa  161  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  27.64 
 
 		 581 aa  161  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.48 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  31.36 
 
 		 528 aa  160  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  28.57 
 
 		 583 aa  160  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  27.95 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  32.21 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>