More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1015 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  38.69 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  35.47 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  34.27 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  39.39 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  24.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  24.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  39.39 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.47 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.47 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.47 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.47 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.69 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>