More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0999 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  77.01 
 
 
463 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  72.22 
 
 
428 aa  648    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  76.27 
 
 
437 aa  698    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  74.6 
 
 
440 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  74.88 
 
 
434 aa  688    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  74.42 
 
 
434 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  74.35 
 
 
427 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  79.73 
 
 
437 aa  731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  73.41 
 
 
427 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  74.01 
 
 
432 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  100 
 
 
438 aa  895    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  74.88 
 
 
434 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  74.53 
 
 
441 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  72.48 
 
 
427 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  75.41 
 
 
431 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  72.41 
 
 
427 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  74.88 
 
 
434 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  75.99 
 
 
434 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  65.3 
 
 
436 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  66.04 
 
 
432 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  66.35 
 
 
440 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  64.38 
 
 
431 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  67.14 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  66.75 
 
 
450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  63.68 
 
 
436 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  62.38 
 
 
428 aa  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  59.38 
 
 
425 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  60.19 
 
 
427 aa  528  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  57.89 
 
 
425 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  60.29 
 
 
428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  59.43 
 
 
427 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  56.55 
 
 
428 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  58.03 
 
 
433 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  58.08 
 
 
430 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  57.38 
 
 
430 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  58.03 
 
 
429 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  58.63 
 
 
428 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  59.85 
 
 
427 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  55.25 
 
 
429 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  55.3 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  55.48 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  57.79 
 
 
435 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  58.12 
 
 
436 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  56.54 
 
 
434 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  58.74 
 
 
434 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  59.23 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  57.01 
 
 
434 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  55.48 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  57.58 
 
 
428 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  57.04 
 
 
429 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  57.79 
 
 
430 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  57.28 
 
 
429 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  56.54 
 
 
434 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  57.79 
 
 
430 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  57.75 
 
 
430 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  57 
 
 
434 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  58.33 
 
 
433 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  58.57 
 
 
433 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  58.57 
 
 
433 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  58.33 
 
 
433 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  57.07 
 
 
429 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  58.57 
 
 
433 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  58.57 
 
 
433 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  58.1 
 
 
433 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  57.62 
 
 
433 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  57.62 
 
 
433 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  55.71 
 
 
429 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  53.7 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  58.82 
 
 
428 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  56.66 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  57.55 
 
 
433 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  58.87 
 
 
432 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  55.9 
 
 
429 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  56.61 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  57.86 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  56.67 
 
 
433 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  54.44 
 
 
425 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  56 
 
 
432 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  56.43 
 
 
433 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  58.58 
 
 
428 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  55.66 
 
 
430 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  56.46 
 
 
429 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  56.28 
 
 
429 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  54.44 
 
 
428 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  56.9 
 
 
431 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  56.73 
 
 
432 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  55.22 
 
 
437 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  56.01 
 
 
429 aa  484  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  56.4 
 
 
436 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  54.14 
 
 
427 aa  487  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  56.28 
 
 
429 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  58.33 
 
 
428 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  55.3 
 
 
438 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>