134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0955 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  40.33 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  43.7 
 
 		 267 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  39.06 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  34.33 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  39.33 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  37.25 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  38.85 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  37.25 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  37.13 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  60.17 
 
 		 120 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  36.24 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  39.12 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  36.93 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  35.56 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  35.1 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  35.91 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  33.1 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  36.93 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  37.37 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  33 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  36.4 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  37.34 
 
 		 262 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  37.82 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  36.64 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  38.55 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  33.64 
 
 		 277 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  34.41 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  35.52 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  33.18 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  33.18 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  41.04 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  32.22 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  32.22 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.7 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.02 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  32.26 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  32.26 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  32.26 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  33.91 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  35.78 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  36.17 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.31 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.31 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.31 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.88 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  32.18 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  32.18 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  32.18 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  40.54 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  33.71 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  32.39 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  29.92 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  40.16 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  35.8 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  33.04 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  33.08 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  33.08 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  31.14 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  31.48 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  32.04 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  33.71 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  35.02 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  30.58 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  31.5 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  32.89 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  33.1 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.49 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  29.57 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  31.15 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  31.15 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  39.67 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  35.14 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  30.26 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.6 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  31.96 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  32.34 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  32.21 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  33.19 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  33.93 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  31.31 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  34.06 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  34.32 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  28.62 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.43 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  33.52 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  27.3 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  30.56 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  33.16 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  29.29 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  34.13 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  30.23 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  26.6 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  30.85 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  30.85 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>