More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0908 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  68.02 
 
 		 226 aa  277  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  67.51 
 
 		 227 aa  276  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  65.7 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  64.97 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  62.25 
 
 		 211 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 200 aa  254  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  62.76 
 
 		 218 aa  247  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  62.18 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  61.42 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 330 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  61.14 
 
 		 245 aa  244  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  59.69 
 
 		 271 aa  234  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 197 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  59.3 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  56.85 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  57.51 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  58.03 
 
 		 317 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  55.78 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.5 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 238 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 256 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  29.47 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  52.54 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  23.15 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>