111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0905 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 366 aa  728    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  43.62 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  42.65 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  39.83 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  41.78 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  38.8 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  39.95 
 
 		 473 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  38.11 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  39.68 
 
 		 427 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  38.06 
 
 		 479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  34.88 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  38.42 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  38.11 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  35.46 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  35.83 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  33.51 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  38.12 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  34.78 
 
 		 547 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  38.81 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  31.49 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  35.18 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  35.18 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  35.18 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  35.17 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  35.17 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  35.29 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  44.06 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  29.95 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  40.17 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  34.93 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  30.23 
 
 		 495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  32.63 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  33.45 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  36.06 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  29.86 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  30.41 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  27.92 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  27.37 
 
 		 479 aa  99.8  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  26.6 
 
 		 460 aa  90.9  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  28.96 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  27.53 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.35 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  30.71 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  26.18 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  53.73 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  51.32 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  49.35 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  46.99 
 
 		 118 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  46.99 
 
 		 118 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  46.99 
 
 		 118 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  47.06 
 
 		 107 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  46.25 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  46.67 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  47.3 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  48.1 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  23.02 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  49.3 
 
 		 176 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  44.74 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  44.74 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  44.74 
 
 		 171 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  45.33 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  44.05 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  47.3 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  51.25 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  45.21 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  46.58 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  41.46 
 
 		 225 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  38.94 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  37.89 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  43.21 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  22.3 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  24.5 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  44.93 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  36.11 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  35.16 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  41.1 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  48.33 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  21.4 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  27.59 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  43.84 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  41.38 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  47.76 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  29.82 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  38.55 
 
 		 181 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  29.82 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  38.55 
 
 		 152 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  29.69 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  38.55 
 
 		 152 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  42.31 
 
 		 328 aa  52.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  41.43 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  44.16 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  44.16 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  44.3 
 
 		 192 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  40.54 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  40.79 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  40.91 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  40.91 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  40.91 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>