More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0823 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  100 
 
 
322 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4538  aldo/keto reductase  66.87 
 
 
323 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.835863  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  65.63 
 
 
328 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0264  aldo/keto reductase  64.09 
 
 
323 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2127  aldo/keto reductase  64.71 
 
 
323 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  61.92 
 
 
323 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1976  aldo/keto reductase  65.33 
 
 
323 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0490  aldo/keto reductase  62.85 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.828014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  60.24 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8885  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  61.8 
 
 
322 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0112  aldo/keto reductase  63.78 
 
 
323 aa  394  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  62.94 
 
 
328 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3318  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
327 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0621997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  57.75 
 
 
329 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4717  aldo/keto reductase  56.71 
 
 
328 aa  360  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2120  aldo/keto reductase  58.79 
 
 
330 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1837  aldo/keto reductase  58.18 
 
 
330 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
328 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1755  aldo/keto reductase  58.18 
 
 
330 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2595  aldo/keto reductase  58.1 
 
 
325 aa  346  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  55.31 
 
 
341 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
333 aa  245  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
327 aa  242  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  41.09 
 
 
326 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  43.08 
 
 
325 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.98 
 
 
332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  45.34 
 
 
340 aa  231  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
326 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
329 aa  228  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
325 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
341 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
353 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
325 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  39.24 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.77 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
360 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
328 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.9 
 
 
345 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
352 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
326 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
332 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
338 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  41.34 
 
 
332 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
326 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
351 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.77 
 
 
336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  37.91 
 
 
349 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
338 aa  215  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  42.63 
 
 
337 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
338 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  37.43 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.58 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  41.1 
 
 
341 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
352 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.1 
 
 
331 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  40.06 
 
 
327 aa  212  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
323 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
344 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
343 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
322 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  39.52 
 
 
350 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  37.8 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  40 
 
 
352 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
351 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
358 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
343 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
349 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
331 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
326 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  40.18 
 
 
324 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
326 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
325 aa  208  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
359 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.05 
 
 
335 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  38.25 
 
 
346 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
343 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.99 
 
 
339 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
349 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
349 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
322 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
339 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  37.74 
 
 
323 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  36.02 
 
 
342 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
349 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  37.39 
 
 
342 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
358 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.81 
 
 
343 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
326 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>