186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0821 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 188 aa  356  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  42.47 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  38.6 
 
 		 215 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  42.08 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  41.21 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  39.67 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  37.43 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  46.75 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  46.75 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  38.46 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  45.86 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  40.91 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  36.26 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.99 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  38.95 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  32.29 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  35.64 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  38.95 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  36.78 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  36.76 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.19 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.54 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  38.82 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.64 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  34.78 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.69 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.56 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  25 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  25 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  37.97 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  26.37 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  33.08 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  34.02 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.88 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  40.64 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  38.17 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.07 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.92 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  27.1 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  38.06 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  35.88 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  34.04 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  36.17 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  37.91 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  35.61 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  39.82 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  34 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  26.74 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.31 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.94 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  36.96 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  33.93 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  38.57 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  34.31 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.78 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.3 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  30.08 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  25.54 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  25.37 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  28.96 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.88 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  32.79 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  35.33 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  36.46 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  31.84 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  32.46 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  36.97 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  36.28 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.72 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  22.56 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  38.05 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  29.03 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  33.57 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  33.94 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>