More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0795 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
983 aa  1833    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 
993 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  42.51 
 
 
916 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 
982 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  43.03 
 
 
967 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  40.99 
 
 
970 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  40.22 
 
 
1006 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  43.71 
 
 
953 aa  429  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  38.58 
 
 
992 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  39.75 
 
 
967 aa  311  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
973 aa  307  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  42.21 
 
 
954 aa  296  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 
981 aa  274  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 
1005 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  34.83 
 
 
900 aa  264  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  37.92 
 
 
1084 aa  260  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 
1013 aa  248  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  34.81 
 
 
964 aa  237  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  40.46 
 
 
999 aa  208  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 
937 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 
959 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  35.98 
 
 
1054 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 
1022 aa  141  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
895 aa  137  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.27 
 
 
1020 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.68 
 
 
1123 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.38 
 
 
1422 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 
1429 aa  131  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 
1015 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  36.26 
 
 
1075 aa  128  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.02 
 
 
1123 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 
1029 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.04 
 
 
1051 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 
1160 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  30.07 
 
 
1271 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  31.09 
 
 
1198 aa  124  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.46 
 
 
1121 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  32.03 
 
 
1118 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.78 
 
 
1029 aa  121  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
881 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  35.26 
 
 
1071 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.99 
 
 
1441 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 
1139 aa  118  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
1048 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.87 
 
 
1089 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
1037 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  35.14 
 
 
1116 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.57 
 
 
1295 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.38 
 
 
1080 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.78 
 
 
1141 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 
1123 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 
966 aa  112  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
1148 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 
1105 aa  108  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
1402 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 
905 aa  107  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  31.74 
 
 
1141 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  31.74 
 
 
1141 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.25 
 
 
1081 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 
864 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  33.33 
 
 
723 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.16 
 
 
1134 aa  104  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 
1151 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
1094 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.5 
 
 
1141 aa  104  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.6 
 
 
713 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.22 
 
 
1133 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 
1151 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.11 
 
 
1122 aa  103  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.17 
 
 
1126 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 
1007 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.49 
 
 
1666 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
1346 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.68 
 
 
1055 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.81 
 
 
1150 aa  102  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1142 aa  102  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  32.56 
 
 
1118 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  33.33 
 
 
1118 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  32.04 
 
 
1141 aa  101  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
1400 aa  101  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 
973 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.12 
 
 
1149 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.21 
 
 
1114 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.38 
 
 
1403 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.63 
 
 
1138 aa  100  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
1398 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 
862 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
1403 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.67 
 
 
1053 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
1320 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.4 
 
 
1291 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.86 
 
 
1175 aa  98.6  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.4 
 
 
914 aa  97.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  33.41 
 
 
1101 aa  97.8  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.68 
 
 
1774 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.82 
 
 
1055 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  28.73 
 
 
963 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  22.33 
 
 
1934 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
1383 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.17 
 
 
1148 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>