99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0772 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  100 
 
 		 69 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  60.87 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  53.62 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  55.07 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  63.24 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  57.97 
 
 		 70 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  55.88 
 
 		 73 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  55.07 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  55.71 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  55.88 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  58.21 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  53.62 
 
 		 70 aa  83.6  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  55.07 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  55.88 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  49.28 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  53.62 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  55.88 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  52.17 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2504  protein of unknown function DUF1458  49.28 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  52.94 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  50.72 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  53.03 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0100  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  52.94 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0234  hypothetical protein  52.94 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.970646  normal  0.774403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4314  protein of unknown function DUF1458  48.53 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.302415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4204  protein of unknown function DUF1458  48.53 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0155  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  46.38 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  47.83 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  47.14 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  45.59 
 
 		 68 aa  76.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  48.53 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  48.53 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  45.71 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  48.53 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  47.83 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  44.12 
 
 		 70 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3623  protein of unknown function DUF1458  45.59 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675874  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  48.57 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1015  hypothetical protein  47.83 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.687737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0104  hypothetical protein  45.71 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  46.38 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0101  hypothetical protein  44.29 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000474292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  44.12 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0037  hypothetical protein  47.14 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0086  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  46.38 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0101  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  48.48 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  44.12 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  44.78 
 
 		 70 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  44.78 
 
 		 70 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0923  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  46.88 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  46.38 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  42.65 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0188  hypothetical protein  54.55 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05065  hypothetical protein  47.06 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  43.75 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0927  hypothetical protein  41.79 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  37.31 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0896  hypothetical protein  40.3 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2626  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.679626  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  35.82 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0033  protein of unknown function DUF1458  47.83 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0195  hypothetical protein  38.24 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0718  hypothetical protein  38.24 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0051  protein of unknown function DUF1458  43.48 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0177  hypothetical protein  38.24 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0882703  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4753  hypothetical protein  54.35 
 
 		 46 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.720528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  44.62 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  34.85 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0020  protein of unknown function DUF1458  30.77 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  36.92 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  28.79 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>