32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0761 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0761    100 
 
 		 510 bp  1011    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000464715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2632    92.5 
 
 		 1449 bp  167  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  87.31 
 
 		 1389 bp  131  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  85.06 
 
 		 1389 bp  123  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  85.06 
 
 		 1389 bp  123  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  85.06 
 
 		 1389 bp  123  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  85.06 
 
 		 1389 bp  123  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5786    83.89 
 
 		 1385 bp  105  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  86.49 
 
 		 1395 bp  67.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  83.16 
 
 		 1398 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  83.16 
 
 		 1398 bp  61.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  96.97 
 
 		 570 bp  58  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  92.31 
 
 		 384 bp  54  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  91.89 
 
 		 1302 bp  50.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  91.89 
 
 		 1302 bp  50.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  91.89 
 
 		 1302 bp  50.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 		 1398 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 		 1398 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 		 1398 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 		 1398 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 		 1398 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  87.23 
 
 		 1398 bp  46.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 1431 bp  46.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 1407 bp  46.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>