39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0591 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  100 
 
 
357 aa  634    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  36.64 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  38.48 
 
 
359 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  40.11 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  43.37 
 
 
364 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  41.26 
 
 
365 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  42.73 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  43.46 
 
 
359 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  41.7 
 
 
346 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  42.55 
 
 
353 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  42.55 
 
 
353 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  42.91 
 
 
353 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  34.68 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  41.35 
 
 
348 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  42.96 
 
 
350 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  38.91 
 
 
366 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  39.82 
 
 
366 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  38.48 
 
 
348 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  45.53 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  42.94 
 
 
371 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  36.57 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  42.93 
 
 
569 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  36.14 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  36.24 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  38.02 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  42.06 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  36.44 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  34.86 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  39.11 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  36.05 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  37.23 
 
 
402 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  42.6 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  34.21 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.42 
 
 
390 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  28.04 
 
 
587 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1298  chromosome partitioning ATPase  41.43 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0119  hypothetical protein  41.77 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0445  septum site-determining protein MinD  24.56 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.103592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  26 
 
 
269 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>