45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0570 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 182 aa  357  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  51.08 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  52.38 
 
 		 147 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 145 aa  95.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 147 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  36.24 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  47.93 
 
 		 158 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 157 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  42.57 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  38.57 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  31.29 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 334 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26.09 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>