More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0568 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
226 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  46.98 
 
 
220 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.91 
 
 
231 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.39 
 
 
238 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  38.05 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  37.25 
 
 
221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.76 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  36.76 
 
 
221 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  36.76 
 
 
221 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  36.1 
 
 
221 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
221 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.45 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.27 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  36.84 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.82 
 
 
221 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.82 
 
 
221 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  39.23 
 
 
221 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  39.23 
 
 
221 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  39.25 
 
 
231 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.12 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.67 
 
 
228 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.98 
 
 
229 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  42.11 
 
 
214 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  44.71 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  50.27 
 
 
225 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  50.27 
 
 
225 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  50.27 
 
 
225 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  44.6 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
217 aa  132  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.74 
 
 
217 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.03 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  34.69 
 
 
245 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.55 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.86 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  47.83 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  33.8 
 
 
224 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.29 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
224 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  42.23 
 
 
247 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
215 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  35.1 
 
 
216 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  33.95 
 
 
237 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  35.55 
 
 
216 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  34.06 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  34.72 
 
 
220 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.39 
 
 
220 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.86 
 
 
235 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  31.9 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  38.43 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.22 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.46 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  44.26 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.15 
 
 
252 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  31.16 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.73 
 
 
221 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  33.33 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.91 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
209 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  36.76 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 
226 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  29.27 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.84 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.5 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2191  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0671825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  36.63 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  30.59 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.6 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4225  phosphatase-like  34.71 
 
 
219 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559723  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.65 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  28.34 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  34.71 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  34.71 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  36.55 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1071  HAD family hydrolase  34.71 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357132  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  34.47 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.07 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2916  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.13 
 
 
237 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0271792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2861  HAD superfamily hydrolase  34.13 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0565933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.28 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2800  HAD superfamily hydrolase  34.13 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00584417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1709  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.13 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0748768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>