136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0566 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  100 
 
 
253 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  54.55 
 
 
244 aa  232  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  60.83 
 
 
241 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  60.92 
 
 
244 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  55.06 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  59.17 
 
 
250 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  50.82 
 
 
246 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  56.85 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  55.07 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  53.72 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  55.46 
 
 
243 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  48.36 
 
 
266 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  55.6 
 
 
248 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  49.79 
 
 
249 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  43.15 
 
 
249 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  49.79 
 
 
244 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  56.85 
 
 
248 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  50.62 
 
 
259 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  48.95 
 
 
249 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  48.98 
 
 
259 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  52.26 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  47.79 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  50.83 
 
 
242 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  50.83 
 
 
242 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  50.83 
 
 
242 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  52.5 
 
 
245 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  47.74 
 
 
265 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  49.55 
 
 
247 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  42.26 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  49.55 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  42.26 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  55.23 
 
 
239 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  48.23 
 
 
253 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  40.49 
 
 
252 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  47.13 
 
 
273 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  45.49 
 
 
251 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  47.92 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  51.44 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  49 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  46.59 
 
 
273 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  44.18 
 
 
253 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  48.55 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  50.2 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  45.41 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  49.78 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  47.98 
 
 
255 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  47.35 
 
 
243 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  47.35 
 
 
243 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  46.02 
 
 
230 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  47.81 
 
 
287 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  49.39 
 
 
266 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  50.67 
 
 
250 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  41.18 
 
 
248 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  45.9 
 
 
245 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  45.64 
 
 
245 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  44.8 
 
 
229 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  47.42 
 
 
249 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  41.57 
 
 
257 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  47.79 
 
 
243 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  43.5 
 
 
242 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  41.59 
 
 
239 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  44.84 
 
 
242 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  46.47 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  43.5 
 
 
242 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  39.91 
 
 
246 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  38.03 
 
 
246 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  41.92 
 
 
239 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  38.05 
 
 
262 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  41.59 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  43.05 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  42.04 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  47.75 
 
 
256 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  43.75 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  45.87 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  45.33 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  45.58 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  46.46 
 
 
246 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  42.86 
 
 
243 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  48.2 
 
 
253 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  44.67 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  32.49 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  29.8 
 
 
407 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  28.69 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  32.39 
 
 
259 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  39.75 
 
 
255 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  27.17 
 
 
655 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  32.68 
 
 
269 aa  85.9  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  30.9 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  30.89 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  27.72 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.12 
 
 
512 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  26.78 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  27.66 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>