73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0548 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  56.18 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  62.64 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  55.06 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  51.55 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  50.55 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  54.55 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  57.3 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  51.76 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  44.32 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  44.44 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  46.25 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  46.05 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  45.74 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  39.33 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  32.22 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  44.94 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 327 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  37.63 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  35.48 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  38.71 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  39.56 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  35.63 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  29.49 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  31.58 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  37.66 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  39.24 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 		 332 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 123 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>