90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0541 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  100 
 
 		 244 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  48.88 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  42.5 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  42.98 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  43.28 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.66 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.05 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  25 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  24.14 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  30.29 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.8 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.99 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.79 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.99 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  40.37 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.02 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  29.74 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.92 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.31 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.2 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  39.33 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  27.31 
 
 		 599 aa  82.8  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.7 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.93 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  31.56 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.42 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.11 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  37.32 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.59 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.55 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  22.58 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.59 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.67 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  29.5 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.79 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  28.18 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  28.18 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  28.18 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.79 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  27.73 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  27.27 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.64 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  35.04 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.48 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.56 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.88 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  27.51 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.43 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.71 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.9 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.38 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  22.06 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  23.81 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.12 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.59 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.77 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.05 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.09 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  28.97 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.6 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5177  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  39.81 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0994  cobalt ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.05 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.36 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  24.59 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.03 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.97 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.64 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  25.38 
 
 		 311 aa  45.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1961  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.89 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.688465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.69 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.98 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0296  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.64 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.09 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.45 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.77 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.87 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1280  cobalt ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.78 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.13 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1452  cobalt transport protein  32.56 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0864828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  32.61 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0691  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.32 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.82 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.890786  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  29.93 
 
 		 254 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>