More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0528 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 384 aa  741    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  61.28 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  60.06 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  63.22 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  60.71 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  63.66 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  61.7 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  62.33 
 
 		 501 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  58.26 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  61.62 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  61 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.5 
 
 		 486 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  59.89 
 
 		 512 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  59.44 
 
 		 521 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  61.3 
 
 		 515 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  57.66 
 
 		 517 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  59.34 
 
 		 524 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  59.89 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  58.59 
 
 		 493 aa  348  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  57.22 
 
 		 522 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  56.67 
 
 		 553 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  55.34 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  59.06 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  58.46 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  62.46 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  59.28 
 
 		 530 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  59 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  57.18 
 
 		 515 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  56.91 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  60.3 
 
 		 466 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  53.59 
 
 		 512 aa  332  8e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  58.99 
 
 		 546 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  59.16 
 
 		 495 aa  326  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  56.63 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  56.33 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  56.33 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  56.33 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  54.6 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  49.05 
 
 		 582 aa  322  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  56.29 
 
 		 482 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  53.13 
 
 		 422 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  50.29 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  50 
 
 		 395 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.34 
 
 		 441 aa  308  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  48.18 
 
 		 421 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  47.67 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.48 
 
 		 440 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  49.85 
 
 		 596 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  44.99 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  50.28 
 
 		 553 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  42.27 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  49.72 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  48.09 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  54.44 
 
 		 450 aa  294  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  43.73 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  43.89 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  45.85 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  49.18 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  49.43 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  52.3 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.11 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  46.81 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.66 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.98 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  53.54 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.69 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  46.81 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  48.26 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  49.86 
 
 		 535 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  45.81 
 
 		 574 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  41.83 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  48.69 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  48.63 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.83 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.83 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  48.63 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  46.47 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  49.71 
 
 		 561 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  42.11 
 
 		 419 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  44.81 
 
 		 439 aa  279  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  49.56 
 
 		 549 aa  279  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.58 
 
 		 454 aa  278  8e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  41.83 
 
 		 419 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.9 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.44 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.63 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  39.9 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.26 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.26 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  41.55 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  43.7 
 
 		 597 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  43.7 
 
 		 597 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  46.56 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.26 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  41.55 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  44.74 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  41.83 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  41.83 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.12 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>